Protein–RNA interactions for Protein: P01213

PDYN, Proenkephalin-B, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDYNP01213 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDYNP01213 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDYNP01213 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDYNP01213 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDYNP01213 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDYNP01213 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDYNP01213 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDYNP01213 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDYNP01213 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDYNP01213 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDYNP01213 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDYNP01213 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDYNP01213 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDYNP01213 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDYNP01213 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDYNP01213 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDYNP01213 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDYNP01213 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDYNP01213 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDYNP01213 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDYNP01213 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDYNP01213 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDYNP01213 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDYNP01213 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDYNP01213 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDYNP01213 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDYNP01213 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDYNP01213 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDYNP01213 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDYNP01213 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDYNP01213 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDYNP01213 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDYNP01213 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDYNP01213 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDYNP01213 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDYNP01213 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDYNP01213 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDYNP01213 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDYNP01213 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDYNP01213 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDYNP01213 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDYNP01213 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDYNP01213 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDYNP01213 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDYNP01213 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDYNP01213 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDYNP01213 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDYNP01213 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDYNP01213 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDYNP01213 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDYNP01213 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDYNP01213 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDYNP01213 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDYNP01213 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDYNP01213 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDYNP01213 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDYNP01213 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDYNP01213 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDYNP01213 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDYNP01213 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDYNP01213 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDYNP01213 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDYNP01213 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDYNP01213 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDYNP01213 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDYNP01213 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDYNP01213 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDYNP01213 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDYNP01213 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDYNP01213 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDYNP01213 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDYNP01213 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDYNP01213 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDYNP01213 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDYNP01213 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDYNP01213 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDYNP01213 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDYNP01213 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDYNP01213 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDYNP01213 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDYNP01213 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDYNP01213 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDYNP01213 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDYNP01213 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDYNP01213 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDYNP01213 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDYNP01213 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms