Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL1O95922 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL1O95922 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL1O95922 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TTLL1O95922 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL1O95922 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL1O95922 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL1O95922 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL1O95922 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL1O95922 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTLL1O95922 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTLL1O95922 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL1O95922 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL1O95922 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms