Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB11O95342 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCB11O95342 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB11O95342 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms