Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPXNO60711 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPXNO60711 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LPXNO60711 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LPXNO60711 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPXNO60711 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPXNO60711 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPXNO60711 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LPXNO60711 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPXNO60711 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPXNO60711 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPXNO60711 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LPXNO60711 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPXNO60711 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPXNO60711 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPXNO60711 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPXNO60711 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPXNO60711 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPXNO60711 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPXNO60711 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPXNO60711 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPXNO60711 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPXNO60711 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPXNO60711 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPXNO60711 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPXNO60711 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPXNO60711 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPXNO60711 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPXNO60711 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPXNO60711 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPXNO60711 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPXNO60711 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPXNO60711 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPXNO60711 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPXNO60711 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPXNO60711 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPXNO60711 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPXNO60711 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPXNO60711 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LPXNO60711 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPXNO60711 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPXNO60711 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPXNO60711 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LPXNO60711 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPXNO60711 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPXNO60711 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPXNO60711 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPXNO60711 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPXNO60711 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPXNO60711 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPXNO60711 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPXNO60711 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPXNO60711 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPXNO60711 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPXNO60711 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPXNO60711 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPXNO60711 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPXNO60711 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPXNO60711 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPXNO60711 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPXNO60711 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPXNO60711 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPXNO60711 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPXNO60711 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPXNO60711 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms