Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NOBOXO60393 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms