Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH7O60245 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH7O60245 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms