Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTSS1O43312 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTSS1O43312 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms