Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPAA1O43292 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPAA1O43292 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms