Protein–RNA interactions for Protein: O15055

PER2, Period circadian protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER2O15055 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PER2O15055 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PER2O15055 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PER2O15055 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PER2O15055 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PER2O15055 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PER2O15055 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PER2O15055 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PER2O15055 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PER2O15055 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PER2O15055 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PER2O15055 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PER2O15055 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PER2O15055 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PER2O15055 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PER2O15055 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PER2O15055 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PER2O15055 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PER2O15055 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PER2O15055 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PER2O15055 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PER2O15055 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PER2O15055 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PER2O15055 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PER2O15055 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PER2O15055 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PER2O15055 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PER2O15055 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PER2O15055 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PER2O15055 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PER2O15055 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PER2O15055 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PER2O15055 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PER2O15055 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PER2O15055 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PER2O15055 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PER2O15055 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PER2O15055 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PER2O15055 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PER2O15055 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PER2O15055 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PER2O15055 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PER2O15055 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PER2O15055 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PER2O15055 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PER2O15055 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PER2O15055 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PER2O15055 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PER2O15055 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PER2O15055 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PER2O15055 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PER2O15055 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PER2O15055 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PER2O15055 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PER2O15055 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PER2O15055 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PER2O15055 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PER2O15055 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PER2O15055 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PER2O15055 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PER2O15055 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PER2O15055 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PER2O15055 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PER2O15055 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PER2O15055 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PER2O15055 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PER2O15055 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PER2O15055 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PER2O15055 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PER2O15055 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PER2O15055 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PER2O15055 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PER2O15055 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PER2O15055 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PER2O15055 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PER2O15055 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PER2O15055 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PER2O15055 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PER2O15055 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PER2O15055 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PER2O15055 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PER2O15055 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PER2O15055 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PER2O15055 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PER2O15055 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PER2O15055 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PER2O15055 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PER2O15055 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PER2O15055 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PER2O15055 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PER2O15055 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PER2O15055 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PER2O15055 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PER2O15055 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PER2O15055 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PER2O15055 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PER2O15055 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PER2O15055 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PER2O15055 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PER2O15055 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms