Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETD1AO15047 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1AO15047 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SETD1AO15047 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SETD1AO15047 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms