Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR3AO14802 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLR3AO14802 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
POLR3AO14802 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
POLR3AO14802 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
POLR3AO14802 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms