Protein–RNA interactions for Protein: O00337

SLC28A1, Sodium/nucleoside cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A1O00337 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A1O00337 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC28A1O00337 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC28A1O00337 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.9 ms