Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIC1O00299 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLIC1O00299 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.8 ms