Protein–RNA interactions for Protein: H3BSA7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSA7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BSA7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BSA7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BSA7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BSA7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BSA7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BSA7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BSA7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BSA7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BSA7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BSA7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BSA7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BSA7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BSA7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BSA7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BSA7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BSA7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BSA7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BSA7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BSA7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BSA7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BSA7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BSA7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BSA7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BSA7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BSA7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BSA7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BSA7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BSA7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BSA7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BSA7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BSA7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H3BSA7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H3BSA7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
H3BSA7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3BSA7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3BSA7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3BSA7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3BSA7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3BSA7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3BSA7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3BSA7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3BSA7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3BSA7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BSA7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BSA7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BSA7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BSA7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BSA7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BSA7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BSA7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BSA7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BSA7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BSA7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BSA7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BSA7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BSA7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BSA7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BSA7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BSA7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BSA7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BSA7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BSA7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BSA7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BSA7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BSA7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BSA7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BSA7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BSA7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BSA7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BSA7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BSA7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BSA7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BSA7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BSA7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BSA7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BSA7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BSA7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H3BSA7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BSA7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BSA7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BSA7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BSA7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BSA7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 437.5 ms