Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPOPA6NHQ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPOPA6NHQ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms