Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP2A4UGR9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms