Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X4

FAM169A, Soluble lamin-associated protein of 75 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM169AQ9Y6X4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAM169AQ9Y6X4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FAM169AQ9Y6X4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM169AQ9Y6X4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM169AQ9Y6X4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM169AQ9Y6X4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM169AQ9Y6X4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM169AQ9Y6X4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM169AQ9Y6X4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM169AQ9Y6X4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM169AQ9Y6X4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAM169AQ9Y6X4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAM169AQ9Y6X4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM169AQ9Y6X4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM169AQ9Y6X4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM169AQ9Y6X4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM169AQ9Y6X4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM169AQ9Y6X4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM169AQ9Y6X4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FAM169AQ9Y6X4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FAM169AQ9Y6X4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM169AQ9Y6X4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM169AQ9Y6X4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM169AQ9Y6X4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAM169AQ9Y6X4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FAM169AQ9Y6X4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM169AQ9Y6X4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM169AQ9Y6X4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM169AQ9Y6X4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM169AQ9Y6X4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM169AQ9Y6X4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM169AQ9Y6X4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM169AQ9Y6X4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM169AQ9Y6X4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM169AQ9Y6X4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM169AQ9Y6X4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM169AQ9Y6X4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM169AQ9Y6X4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FAM169AQ9Y6X4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM169AQ9Y6X4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM169AQ9Y6X4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM169AQ9Y6X4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM169AQ9Y6X4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM169AQ9Y6X4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM169AQ9Y6X4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM169AQ9Y6X4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM169AQ9Y6X4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM169AQ9Y6X4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM169AQ9Y6X4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM169AQ9Y6X4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM169AQ9Y6X4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM169AQ9Y6X4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM169AQ9Y6X4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM169AQ9Y6X4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM169AQ9Y6X4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM169AQ9Y6X4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM169AQ9Y6X4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FAM169AQ9Y6X4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM169AQ9Y6X4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM169AQ9Y6X4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM169AQ9Y6X4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM169AQ9Y6X4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM169AQ9Y6X4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM169AQ9Y6X4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM169AQ9Y6X4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM169AQ9Y6X4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM169AQ9Y6X4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM169AQ9Y6X4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM169AQ9Y6X4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM169AQ9Y6X4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM169AQ9Y6X4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM169AQ9Y6X4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM169AQ9Y6X4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM169AQ9Y6X4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM169AQ9Y6X4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM169AQ9Y6X4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM169AQ9Y6X4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM169AQ9Y6X4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM169AQ9Y6X4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM169AQ9Y6X4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM169AQ9Y6X4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM169AQ9Y6X4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM169AQ9Y6X4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM169AQ9Y6X4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM169AQ9Y6X4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM169AQ9Y6X4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM169AQ9Y6X4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM169AQ9Y6X4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM169AQ9Y6X4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms