Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USH1CQ9Y6N9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USH1CQ9Y6N9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USH1CQ9Y6N9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USH1CQ9Y6N9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USH1CQ9Y6N9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USH1CQ9Y6N9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USH1CQ9Y6N9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USH1CQ9Y6N9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USH1CQ9Y6N9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USH1CQ9Y6N9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USH1CQ9Y6N9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USH1CQ9Y6N9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USH1CQ9Y6N9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USH1CQ9Y6N9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USH1CQ9Y6N9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USH1CQ9Y6N9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USH1CQ9Y6N9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USH1CQ9Y6N9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USH1CQ9Y6N9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USH1CQ9Y6N9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USH1CQ9Y6N9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USH1CQ9Y6N9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USH1CQ9Y6N9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USH1CQ9Y6N9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USH1CQ9Y6N9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USH1CQ9Y6N9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USH1CQ9Y6N9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USH1CQ9Y6N9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
USH1CQ9Y6N9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USH1CQ9Y6N9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USH1CQ9Y6N9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USH1CQ9Y6N9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USH1CQ9Y6N9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USH1CQ9Y6N9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USH1CQ9Y6N9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USH1CQ9Y6N9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USH1CQ9Y6N9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USH1CQ9Y6N9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USH1CQ9Y6N9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USH1CQ9Y6N9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USH1CQ9Y6N9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USH1CQ9Y6N9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USH1CQ9Y6N9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USH1CQ9Y6N9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USH1CQ9Y6N9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USH1CQ9Y6N9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USH1CQ9Y6N9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USH1CQ9Y6N9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USH1CQ9Y6N9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USH1CQ9Y6N9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USH1CQ9Y6N9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USH1CQ9Y6N9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USH1CQ9Y6N9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USH1CQ9Y6N9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USH1CQ9Y6N9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USH1CQ9Y6N9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USH1CQ9Y6N9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USH1CQ9Y6N9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USH1CQ9Y6N9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USH1CQ9Y6N9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USH1CQ9Y6N9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USH1CQ9Y6N9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USH1CQ9Y6N9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USH1CQ9Y6N9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USH1CQ9Y6N9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USH1CQ9Y6N9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USH1CQ9Y6N9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USH1CQ9Y6N9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USH1CQ9Y6N9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USH1CQ9Y6N9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USH1CQ9Y6N9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USH1CQ9Y6N9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USH1CQ9Y6N9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USH1CQ9Y6N9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USH1CQ9Y6N9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms