Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC52.65■■■■■ 6.02
LAMC3Q9Y6N6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.65■■■■■ 6.02
LAMC3Q9Y6N6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
LAMC3Q9Y6N6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
LAMC3Q9Y6N6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.61■■■■■ 6.01
LAMC3Q9Y6N6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
LAMC3Q9Y6N6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC52.51■■■■■ 6
LAMC3Q9Y6N6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
LAMC3Q9Y6N6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.47■■■■■ 5.99
LAMC3Q9Y6N6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC52.42■■■■■ 5.98
LAMC3Q9Y6N6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC52.21■■■■■ 5.95
LAMC3Q9Y6N6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
LAMC3Q9Y6N6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC52.12■■■■■ 5.93
LAMC3Q9Y6N6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC52.12■■■■■ 5.93
LAMC3Q9Y6N6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC52.04■■■■■ 5.92
LAMC3Q9Y6N6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC52.03■■■■■ 5.92
LAMC3Q9Y6N6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC52■■■■■ 5.91
LAMC3Q9Y6N6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.86■■■■■ 5.89
LAMC3Q9Y6N6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.85■■■■■ 5.89
LAMC3Q9Y6N6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC51.83■■■■■ 5.89
LAMC3Q9Y6N6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
LAMC3Q9Y6N6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
LAMC3Q9Y6N6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
LAMC3Q9Y6N6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC51.7■■■■■ 5.87
LAMC3Q9Y6N6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
LAMC3Q9Y6N6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
LAMC3Q9Y6N6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC51.65■■■■■ 5.86
LAMC3Q9Y6N6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC51.6■■■■■ 5.85
LAMC3Q9Y6N6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
LAMC3Q9Y6N6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC51.56■■■■■ 5.84
LAMC3Q9Y6N6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC51.55■■■■■ 5.84
LAMC3Q9Y6N6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
LAMC3Q9Y6N6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
LAMC3Q9Y6N6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC51.52■■■■■ 5.84
LAMC3Q9Y6N6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
LAMC3Q9Y6N6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.47■■■■■ 5.83
LAMC3Q9Y6N6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.47■■■■■ 5.83
LAMC3Q9Y6N6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
LAMC3Q9Y6N6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
LAMC3Q9Y6N6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC51.44■■■■■ 5.82
LAMC3Q9Y6N6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC51.4■■■■■ 5.82
LAMC3Q9Y6N6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC51.32■■■■■ 5.81
LAMC3Q9Y6N6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC51.29■■■■■ 5.8
LAMC3Q9Y6N6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC51.28■■■■■ 5.8
LAMC3Q9Y6N6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
LAMC3Q9Y6N6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC51.21■■■■■ 5.79
LAMC3Q9Y6N6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC51.19■■■■■ 5.79
LAMC3Q9Y6N6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC51.15■■■■■ 5.78
LAMC3Q9Y6N6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC51.14■■■■■ 5.78
LAMC3Q9Y6N6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
LAMC3Q9Y6N6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
LAMC3Q9Y6N6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC51.05■■■■■ 5.76
LAMC3Q9Y6N6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
LAMC3Q9Y6N6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC51.02■■■■■ 5.76
LAMC3Q9Y6N6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.02■■■■■ 5.76
LAMC3Q9Y6N6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC51.01■■■■■ 5.76
LAMC3Q9Y6N6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC50.98■■■■■ 5.75
LAMC3Q9Y6N6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
LAMC3Q9Y6N6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
LAMC3Q9Y6N6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.94■■■■■ 5.75
LAMC3Q9Y6N6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC50.89■■■■■ 5.74
LAMC3Q9Y6N6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.88■■■■■ 5.74
LAMC3Q9Y6N6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
LAMC3Q9Y6N6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.85■■■■■ 5.73
LAMC3Q9Y6N6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC50.85■■■■■ 5.73
LAMC3Q9Y6N6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC50.82■■■■■ 5.73
LAMC3Q9Y6N6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
LAMC3Q9Y6N6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
LAMC3Q9Y6N6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.73■■■■■ 5.71
LAMC3Q9Y6N6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
LAMC3Q9Y6N6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
LAMC3Q9Y6N6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
LAMC3Q9Y6N6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
LAMC3Q9Y6N6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
LAMC3Q9Y6N6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC50.59■■■■■ 5.69
LAMC3Q9Y6N6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC50.58■■■■■ 5.69
LAMC3Q9Y6N6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
LAMC3Q9Y6N6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
LAMC3Q9Y6N6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
LAMC3Q9Y6N6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC50.53■■■■■ 5.68
LAMC3Q9Y6N6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.51■■■■■ 5.68
LAMC3Q9Y6N6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
LAMC3Q9Y6N6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC50.45■■■■■ 5.67
LAMC3Q9Y6N6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
LAMC3Q9Y6N6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
LAMC3Q9Y6N6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
LAMC3Q9Y6N6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
LAMC3Q9Y6N6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC50.38■■■■■ 5.66
LAMC3Q9Y6N6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC50.36■■■■■ 5.65
LAMC3Q9Y6N6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.34■■■■■ 5.65
LAMC3Q9Y6N6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
LAMC3Q9Y6N6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
LAMC3Q9Y6N6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC50.31■■■■■ 5.64
LAMC3Q9Y6N6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
LAMC3Q9Y6N6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC50.27■■■■■ 5.64
LAMC3Q9Y6N6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
LAMC3Q9Y6N6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC50.25■■■■■ 5.63
LAMC3Q9Y6N6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC50.21■■■■■ 5.63
LAMC3Q9Y6N6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC50.2■■■■■ 5.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms