Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A1

POMT1, Protein O-mannosyl-transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMT1Q9Y6A1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMT1Q9Y6A1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMT1Q9Y6A1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMT1Q9Y6A1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POMT1Q9Y6A1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POMT1Q9Y6A1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POMT1Q9Y6A1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POMT1Q9Y6A1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMT1Q9Y6A1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMT1Q9Y6A1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POMT1Q9Y6A1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POMT1Q9Y6A1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POMT1Q9Y6A1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POMT1Q9Y6A1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POMT1Q9Y6A1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POMT1Q9Y6A1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POMT1Q9Y6A1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POMT1Q9Y6A1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POMT1Q9Y6A1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMT1Q9Y6A1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POMT1Q9Y6A1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POMT1Q9Y6A1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMT1Q9Y6A1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMT1Q9Y6A1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMT1Q9Y6A1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POMT1Q9Y6A1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POMT1Q9Y6A1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POMT1Q9Y6A1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POMT1Q9Y6A1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POMT1Q9Y6A1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POMT1Q9Y6A1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POMT1Q9Y6A1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POMT1Q9Y6A1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POMT1Q9Y6A1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POMT1Q9Y6A1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POMT1Q9Y6A1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POMT1Q9Y6A1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POMT1Q9Y6A1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POMT1Q9Y6A1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POMT1Q9Y6A1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POMT1Q9Y6A1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POMT1Q9Y6A1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POMT1Q9Y6A1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POMT1Q9Y6A1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POMT1Q9Y6A1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POMT1Q9Y6A1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMT1Q9Y6A1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMT1Q9Y6A1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMT1Q9Y6A1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMT1Q9Y6A1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POMT1Q9Y6A1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POMT1Q9Y6A1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POMT1Q9Y6A1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POMT1Q9Y6A1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POMT1Q9Y6A1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POMT1Q9Y6A1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POMT1Q9Y6A1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POMT1Q9Y6A1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMT1Q9Y6A1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMT1Q9Y6A1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMT1Q9Y6A1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMT1Q9Y6A1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMT1Q9Y6A1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMT1Q9Y6A1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMT1Q9Y6A1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POMT1Q9Y6A1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POMT1Q9Y6A1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POMT1Q9Y6A1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMT1Q9Y6A1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMT1Q9Y6A1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMT1Q9Y6A1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMT1Q9Y6A1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMT1Q9Y6A1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMT1Q9Y6A1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMT1Q9Y6A1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POMT1Q9Y6A1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMT1Q9Y6A1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMT1Q9Y6A1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POMT1Q9Y6A1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms