Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S1

TRPV2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV2Q9Y5S1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRPV2Q9Y5S1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRPV2Q9Y5S1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TRPV2Q9Y5S1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPV2Q9Y5S1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRPV2Q9Y5S1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRPV2Q9Y5S1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRPV2Q9Y5S1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRPV2Q9Y5S1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRPV2Q9Y5S1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRPV2Q9Y5S1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRPV2Q9Y5S1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRPV2Q9Y5S1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRPV2Q9Y5S1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRPV2Q9Y5S1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRPV2Q9Y5S1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRPV2Q9Y5S1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRPV2Q9Y5S1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRPV2Q9Y5S1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRPV2Q9Y5S1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRPV2Q9Y5S1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRPV2Q9Y5S1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRPV2Q9Y5S1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRPV2Q9Y5S1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRPV2Q9Y5S1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRPV2Q9Y5S1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRPV2Q9Y5S1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRPV2Q9Y5S1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRPV2Q9Y5S1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRPV2Q9Y5S1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRPV2Q9Y5S1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TRPV2Q9Y5S1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRPV2Q9Y5S1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRPV2Q9Y5S1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRPV2Q9Y5S1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRPV2Q9Y5S1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRPV2Q9Y5S1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRPV2Q9Y5S1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRPV2Q9Y5S1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRPV2Q9Y5S1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRPV2Q9Y5S1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRPV2Q9Y5S1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRPV2Q9Y5S1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRPV2Q9Y5S1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRPV2Q9Y5S1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
TRPV2Q9Y5S1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRPV2Q9Y5S1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRPV2Q9Y5S1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRPV2Q9Y5S1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRPV2Q9Y5S1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRPV2Q9Y5S1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRPV2Q9Y5S1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TRPV2Q9Y5S1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRPV2Q9Y5S1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRPV2Q9Y5S1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRPV2Q9Y5S1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRPV2Q9Y5S1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TRPV2Q9Y5S1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRPV2Q9Y5S1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRPV2Q9Y5S1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRPV2Q9Y5S1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRPV2Q9Y5S1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRPV2Q9Y5S1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TRPV2Q9Y5S1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRPV2Q9Y5S1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRPV2Q9Y5S1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRPV2Q9Y5S1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRPV2Q9Y5S1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRPV2Q9Y5S1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRPV2Q9Y5S1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRPV2Q9Y5S1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRPV2Q9Y5S1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRPV2Q9Y5S1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRPV2Q9Y5S1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRPV2Q9Y5S1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRPV2Q9Y5S1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRPV2Q9Y5S1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TRPV2Q9Y5S1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRPV2Q9Y5S1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRPV2Q9Y5S1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRPV2Q9Y5S1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRPV2Q9Y5S1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TRPV2Q9Y5S1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRPV2Q9Y5S1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRPV2Q9Y5S1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRPV2Q9Y5S1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRPV2Q9Y5S1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRPV2Q9Y5S1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRPV2Q9Y5S1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRPV2Q9Y5S1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRPV2Q9Y5S1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRPV2Q9Y5S1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRPV2Q9Y5S1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRPV2Q9Y5S1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRPV2Q9Y5S1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRPV2Q9Y5S1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRPV2Q9Y5S1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRPV2Q9Y5S1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRPV2Q9Y5S1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRPV2Q9Y5S1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms