Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHGB5Q9Y5G0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHGB5Q9Y5G0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHGB5Q9Y5G0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHGB5Q9Y5G0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHGB5Q9Y5G0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHGB5Q9Y5G0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHGB5Q9Y5G0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHGB5Q9Y5G0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHGB5Q9Y5G0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHGB5Q9Y5G0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHGB5Q9Y5G0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHGB5Q9Y5G0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHGB5Q9Y5G0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHGB5Q9Y5G0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHGB5Q9Y5G0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHGB5Q9Y5G0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHGB5Q9Y5G0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHGB5Q9Y5G0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHGB5Q9Y5G0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHGB5Q9Y5G0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHGB5Q9Y5G0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHGB5Q9Y5G0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHGB5Q9Y5G0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHGB5Q9Y5G0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHGB5Q9Y5G0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHGB5Q9Y5G0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHGB5Q9Y5G0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHGB5Q9Y5G0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHGB5Q9Y5G0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHGB5Q9Y5G0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHGB5Q9Y5G0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHGB5Q9Y5G0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHGB5Q9Y5G0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHGB5Q9Y5G0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHGB5Q9Y5G0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHGB5Q9Y5G0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHGB5Q9Y5G0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHGB5Q9Y5G0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHGB5Q9Y5G0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHGB5Q9Y5G0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHGB5Q9Y5G0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHGB5Q9Y5G0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHGB5Q9Y5G0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHGB5Q9Y5G0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHGB5Q9Y5G0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHGB5Q9Y5G0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHGB5Q9Y5G0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHGB5Q9Y5G0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHGB5Q9Y5G0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHGB5Q9Y5G0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHGB5Q9Y5G0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHGB5Q9Y5G0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHGB5Q9Y5G0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHGB5Q9Y5G0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHGB5Q9Y5G0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHGB5Q9Y5G0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHGB5Q9Y5G0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHGB5Q9Y5G0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHGB5Q9Y5G0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHGB5Q9Y5G0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHGB5Q9Y5G0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHGB5Q9Y5G0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHGB5Q9Y5G0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHGB5Q9Y5G0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDHGB5Q9Y5G0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHGB5Q9Y5G0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHGB5Q9Y5G0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHGB5Q9Y5G0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHGB5Q9Y5G0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHGB5Q9Y5G0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDHGB5Q9Y5G0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHGB5Q9Y5G0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHGB5Q9Y5G0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHGB5Q9Y5G0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHGB5Q9Y5G0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHGB5Q9Y5G0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHGB5Q9Y5G0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHGB5Q9Y5G0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHGB5Q9Y5G0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHGB5Q9Y5G0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHGB5Q9Y5G0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHGB5Q9Y5G0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHGB5Q9Y5G0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHGB5Q9Y5G0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHGB5Q9Y5G0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHGB5Q9Y5G0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms