Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.64■■■■■ 6.82
DCAF1Q9Y4B6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC57.56■■■■■ 6.81
DCAF1Q9Y4B6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC57.53■■■■■ 6.8
DCAF1Q9Y4B6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.51■■■■■ 6.8
DCAF1Q9Y4B6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC57.51■■■■■ 6.8
DCAF1Q9Y4B6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC57.51■■■■■ 6.8
DCAF1Q9Y4B6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.47■■■■■ 6.79
DCAF1Q9Y4B6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC57.46■■■■■ 6.79
DCAF1Q9Y4B6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC57.45■■■■■ 6.79
DCAF1Q9Y4B6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC57.44■■■■■ 6.79
DCAF1Q9Y4B6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC57.33■■■■■ 6.77
DCAF1Q9Y4B6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC57.28■■■■■ 6.76
DCAF1Q9Y4B6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.22■■■■■ 6.75
DCAF1Q9Y4B6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC57.19■■■■■ 6.75
DCAF1Q9Y4B6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.15■■■■■ 6.74
DCAF1Q9Y4B6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC57.13■■■■■ 6.74
DCAF1Q9Y4B6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC57.12■■■■■ 6.73
DCAF1Q9Y4B6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC57.02■■■■■ 6.72
DCAF1Q9Y4B6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC57■■■■■ 6.71
DCAF1Q9Y4B6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC56.99■■■■■ 6.71
DCAF1Q9Y4B6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC56.96■■■■■ 6.71
DCAF1Q9Y4B6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.96■■■■■ 6.71
DCAF1Q9Y4B6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC56.95■■■■■ 6.71
DCAF1Q9Y4B6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.9■■■■■ 6.7
DCAF1Q9Y4B6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC56.84■■■■■ 6.69
DCAF1Q9Y4B6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC56.82■■■■■ 6.69
DCAF1Q9Y4B6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC56.77■■■■■ 6.68
DCAF1Q9Y4B6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC56.77■■■■■ 6.68
DCAF1Q9Y4B6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.77■■■■■ 6.68
DCAF1Q9Y4B6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.76■■■■■ 6.68
DCAF1Q9Y4B6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC56.74■■■■■ 6.67
DCAF1Q9Y4B6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.69■■■■■ 6.67
DCAF1Q9Y4B6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.68■■■■■ 6.66
DCAF1Q9Y4B6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC56.57■■■■■ 6.65
DCAF1Q9Y4B6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.54■■■■■ 6.64
DCAF1Q9Y4B6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC56.52■■■■■ 6.64
DCAF1Q9Y4B6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC56.49■■■■■ 6.63
DCAF1Q9Y4B6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC56.48■■■■■ 6.63
DCAF1Q9Y4B6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC56.46■■■■■ 6.63
DCAF1Q9Y4B6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.44■■■■■ 6.63
DCAF1Q9Y4B6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC56.41■■■■■ 6.62
DCAF1Q9Y4B6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.4■■■■■ 6.62
DCAF1Q9Y4B6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC56.4■■■■■ 6.62
DCAF1Q9Y4B6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC56.37■■■■■ 6.61
DCAF1Q9Y4B6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC56.36■■■■■ 6.61
DCAF1Q9Y4B6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.33■■■■■ 6.61
DCAF1Q9Y4B6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.33■■■■■ 6.61
DCAF1Q9Y4B6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.32■■■■■ 6.61
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC56.3■■■■■ 6.6
DCAF1Q9Y4B6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.3■■■■■ 6.6
DCAF1Q9Y4B6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC56.28■■■■■ 6.6
DCAF1Q9Y4B6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC56.27■■■■■ 6.6
DCAF1Q9Y4B6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC56.26■■■■■ 6.6
DCAF1Q9Y4B6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.26■■■■■ 6.6
DCAF1Q9Y4B6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC56.22■■■■■ 6.59
DCAF1Q9Y4B6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC56.14■■■■■ 6.58
DCAF1Q9Y4B6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC56.11■■■■■ 6.57
DCAF1Q9Y4B6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC56.06■■■■■ 6.56
DCAF1Q9Y4B6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC56.05■■■■■ 6.56
DCAF1Q9Y4B6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.98■■■■■ 6.55
DCAF1Q9Y4B6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC55.96■■■■■ 6.55
DCAF1Q9Y4B6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.95■■■■■ 6.55
DCAF1Q9Y4B6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC55.91■■■■■ 6.54
DCAF1Q9Y4B6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.87■■■■■ 6.54
DCAF1Q9Y4B6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.86■■■■■ 6.53
DCAF1Q9Y4B6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.85■■■■■ 6.53
DCAF1Q9Y4B6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC55.82■■■■■ 6.53
DCAF1Q9Y4B6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.82■■■■■ 6.53
DCAF1Q9Y4B6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC55.79■■■■■ 6.52
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.77■■■■■ 6.52
DCAF1Q9Y4B6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC55.74■■■■■ 6.51
DCAF1Q9Y4B6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC55.72■■■■■ 6.51
DCAF1Q9Y4B6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.67■■■■■ 6.5
DCAF1Q9Y4B6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC55.64■■■■■ 6.5
DCAF1Q9Y4B6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.63■■■■■ 6.5
DCAF1Q9Y4B6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.62■■■■■ 6.49
DCAF1Q9Y4B6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC55.56■■■■■ 6.49
DCAF1Q9Y4B6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.56■■■■■ 6.48
DCAF1Q9Y4B6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC55.55■■■■■ 6.48
DCAF1Q9Y4B6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC55.55■■■■■ 6.48
DCAF1Q9Y4B6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
DCAF1Q9Y4B6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55.51■■■■■ 6.48
DCAF1Q9Y4B6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.49■■■■■ 6.47
DCAF1Q9Y4B6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC55.46■■■■■ 6.47
DCAF1Q9Y4B6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC55.46■■■■■ 6.47
DCAF1Q9Y4B6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.44■■■■■ 6.47
DCAF1Q9Y4B6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC55.4■■■■■ 6.46
DCAF1Q9Y4B6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.39■■■■■ 6.46
DCAF1Q9Y4B6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.35■■■■■ 6.45
DCAF1Q9Y4B6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.33■■■■■ 6.45
DCAF1Q9Y4B6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC55.32■■■■■ 6.45
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.31■■■■■ 6.44
DCAF1Q9Y4B6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.31■■■■■ 6.44
DCAF1Q9Y4B6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC55.29■■■■■ 6.44
DCAF1Q9Y4B6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.28■■■■■ 6.44
DCAF1Q9Y4B6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC55.27■■■■■ 6.44
DCAF1Q9Y4B6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.27■■■■■ 6.44
DCAF1Q9Y4B6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC55.26■■■■■ 6.44
DCAF1Q9Y4B6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC55.19■■■■■ 6.43
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC55.18■■■■■ 6.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms