Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP3M1Q9Y2T2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP3M1Q9Y2T2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3M1Q9Y2T2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3M1Q9Y2T2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP3M1Q9Y2T2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3M1Q9Y2T2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3M1Q9Y2T2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3M1Q9Y2T2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3M1Q9Y2T2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP3M1Q9Y2T2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP3M1Q9Y2T2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP3M1Q9Y2T2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP3M1Q9Y2T2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3M1Q9Y2T2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3M1Q9Y2T2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3M1Q9Y2T2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3M1Q9Y2T2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3M1Q9Y2T2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP3M1Q9Y2T2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3M1Q9Y2T2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP3M1Q9Y2T2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP3M1Q9Y2T2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP3M1Q9Y2T2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP3M1Q9Y2T2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP3M1Q9Y2T2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AP3M1Q9Y2T2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3M1Q9Y2T2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3M1Q9Y2T2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3M1Q9Y2T2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3M1Q9Y2T2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3M1Q9Y2T2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP3M1Q9Y2T2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP3M1Q9Y2T2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP3M1Q9Y2T2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3M1Q9Y2T2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3M1Q9Y2T2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3M1Q9Y2T2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3M1Q9Y2T2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3M1Q9Y2T2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP3M1Q9Y2T2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3M1Q9Y2T2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3M1Q9Y2T2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M1Q9Y2T2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3M1Q9Y2T2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3M1Q9Y2T2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3M1Q9Y2T2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3M1Q9Y2T2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AP3M1Q9Y2T2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3M1Q9Y2T2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3M1Q9Y2T2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3M1Q9Y2T2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3M1Q9Y2T2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M1Q9Y2T2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M1Q9Y2T2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3M1Q9Y2T2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3M1Q9Y2T2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3M1Q9Y2T2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3M1Q9Y2T2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3M1Q9Y2T2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3M1Q9Y2T2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3M1Q9Y2T2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
AP3M1Q9Y2T2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3M1Q9Y2T2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3M1Q9Y2T2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3M1Q9Y2T2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3M1Q9Y2T2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3M1Q9Y2T2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3M1Q9Y2T2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3M1Q9Y2T2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M1Q9Y2T2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M1Q9Y2T2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3M1Q9Y2T2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3M1Q9Y2T2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3M1Q9Y2T2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3M1Q9Y2T2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3M1Q9Y2T2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3M1Q9Y2T2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3M1Q9Y2T2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3M1Q9Y2T2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3M1Q9Y2T2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3M1Q9Y2T2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3M1Q9Y2T2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3M1Q9Y2T2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms