Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PDZRN3Q9UPQ7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PDZRN3Q9UPQ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PDZRN3Q9UPQ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDZRN3Q9UPQ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PDZRN3Q9UPQ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDZRN3Q9UPQ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDZRN3Q9UPQ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PDZRN3Q9UPQ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PDZRN3Q9UPQ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDZRN3Q9UPQ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PDZRN3Q9UPQ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PDZRN3Q9UPQ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PDZRN3Q9UPQ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDZRN3Q9UPQ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDZRN3Q9UPQ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDZRN3Q9UPQ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDZRN3Q9UPQ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDZRN3Q9UPQ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDZRN3Q9UPQ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PDZRN3Q9UPQ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PDZRN3Q9UPQ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PDZRN3Q9UPQ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDZRN3Q9UPQ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDZRN3Q9UPQ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDZRN3Q9UPQ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PDZRN3Q9UPQ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDZRN3Q9UPQ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDZRN3Q9UPQ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDZRN3Q9UPQ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PDZRN3Q9UPQ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PDZRN3Q9UPQ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDZRN3Q9UPQ7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDZRN3Q9UPQ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDZRN3Q9UPQ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDZRN3Q9UPQ7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDZRN3Q9UPQ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDZRN3Q9UPQ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PDZRN3Q9UPQ7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PDZRN3Q9UPQ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDZRN3Q9UPQ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDZRN3Q9UPQ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDZRN3Q9UPQ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDZRN3Q9UPQ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDZRN3Q9UPQ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDZRN3Q9UPQ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDZRN3Q9UPQ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PDZRN3Q9UPQ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDZRN3Q9UPQ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PDZRN3Q9UPQ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PDZRN3Q9UPQ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PDZRN3Q9UPQ7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PDZRN3Q9UPQ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDZRN3Q9UPQ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDZRN3Q9UPQ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PDZRN3Q9UPQ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PDZRN3Q9UPQ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PDZRN3Q9UPQ7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDZRN3Q9UPQ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDZRN3Q9UPQ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDZRN3Q9UPQ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PDZRN3Q9UPQ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDZRN3Q9UPQ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDZRN3Q9UPQ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PDZRN3Q9UPQ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PDZRN3Q9UPQ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDZRN3Q9UPQ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PDZRN3Q9UPQ7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDZRN3Q9UPQ7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PDZRN3Q9UPQ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PDZRN3Q9UPQ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PDZRN3Q9UPQ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PDZRN3Q9UPQ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PDZRN3Q9UPQ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PDZRN3Q9UPQ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDZRN3Q9UPQ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
PDZRN3Q9UPQ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDZRN3Q9UPQ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDZRN3Q9UPQ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PDZRN3Q9UPQ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDZRN3Q9UPQ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms