Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCDHA12Q9UN75 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PCDHA12Q9UN75 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCDHA12Q9UN75 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCDHA12Q9UN75 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCDHA12Q9UN75 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PCDHA12Q9UN75 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PCDHA12Q9UN75 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PCDHA12Q9UN75 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCDHA12Q9UN75 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCDHA12Q9UN75 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PCDHA12Q9UN75 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCDHA12Q9UN75 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCDHA12Q9UN75 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCDHA12Q9UN75 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCDHA12Q9UN75 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCDHA12Q9UN75 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PCDHA12Q9UN75 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCDHA12Q9UN75 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCDHA12Q9UN75 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCDHA12Q9UN75 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PCDHA12Q9UN75 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PCDHA12Q9UN75 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PCDHA12Q9UN75 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PCDHA12Q9UN75 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PCDHA12Q9UN75 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PCDHA12Q9UN75 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PCDHA12Q9UN75 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCDHA12Q9UN75 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCDHA12Q9UN75 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCDHA12Q9UN75 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCDHA12Q9UN75 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PCDHA12Q9UN75 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCDHA12Q9UN75 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCDHA12Q9UN75 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCDHA12Q9UN75 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCDHA12Q9UN75 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCDHA12Q9UN75 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCDHA12Q9UN75 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCDHA12Q9UN75 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCDHA12Q9UN75 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PCDHA12Q9UN75 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCDHA12Q9UN75 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCDHA12Q9UN75 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCDHA12Q9UN75 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCDHA12Q9UN75 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCDHA12Q9UN75 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCDHA12Q9UN75 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCDHA12Q9UN75 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCDHA12Q9UN75 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PCDHA12Q9UN75 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PCDHA12Q9UN75 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PCDHA12Q9UN75 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PCDHA12Q9UN75 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PCDHA12Q9UN75 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PCDHA12Q9UN75 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PCDHA12Q9UN75 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PCDHA12Q9UN75 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PCDHA12Q9UN75 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PCDHA12Q9UN75 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PCDHA12Q9UN75 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PCDHA12Q9UN75 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PCDHA12Q9UN75 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCDHA12Q9UN75 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PCDHA12Q9UN75 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCDHA12Q9UN75 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PCDHA12Q9UN75 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PCDHA12Q9UN75 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCDHA12Q9UN75 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCDHA12Q9UN75 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCDHA12Q9UN75 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCDHA12Q9UN75 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCDHA12Q9UN75 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCDHA12Q9UN75 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCDHA12Q9UN75 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCDHA12Q9UN75 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCDHA12Q9UN75 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCDHA12Q9UN75 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCDHA12Q9UN75 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCDHA12Q9UN75 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCDHA12Q9UN75 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCDHA12Q9UN75 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCDHA12Q9UN75 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCDHA12Q9UN75 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PCDHA12Q9UN75 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PCDHA12Q9UN75 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCDHA12Q9UN75 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCDHA12Q9UN75 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCDHA12Q9UN75 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCDHA12Q9UN75 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms