Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ALKQ9UM73 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
ALKQ9UM73 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
ALKQ9UM73 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ALKQ9UM73 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
ALKQ9UM73 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
ALKQ9UM73 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
ALKQ9UM73 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ALKQ9UM73 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
ALKQ9UM73 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ALKQ9UM73 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ALKQ9UM73 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
ALKQ9UM73 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
ALKQ9UM73 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
ALKQ9UM73 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ALKQ9UM73 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ALKQ9UM73 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ALKQ9UM73 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
ALKQ9UM73 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
ALKQ9UM73 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
ALKQ9UM73 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
ALKQ9UM73 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
ALKQ9UM73 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ALKQ9UM73 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ALKQ9UM73 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
ALKQ9UM73 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ALKQ9UM73 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
ALKQ9UM73 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
ALKQ9UM73 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ALKQ9UM73 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ALKQ9UM73 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ALKQ9UM73 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ALKQ9UM73 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ALKQ9UM73 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ALKQ9UM73 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ALKQ9UM73 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
ALKQ9UM73 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ALKQ9UM73 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ALKQ9UM73 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
ALKQ9UM73 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ALKQ9UM73 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ALKQ9UM73 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ALKQ9UM73 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ALKQ9UM73 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ALKQ9UM73 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ALKQ9UM73 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
ALKQ9UM73 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ALKQ9UM73 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ALKQ9UM73 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ALKQ9UM73 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ALKQ9UM73 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ALKQ9UM73 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ALKQ9UM73 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ALKQ9UM73 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ALKQ9UM73 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ALKQ9UM73 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ALKQ9UM73 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ALKQ9UM73 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ALKQ9UM73 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ALKQ9UM73 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ALKQ9UM73 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ALKQ9UM73 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ALKQ9UM73 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ALKQ9UM73 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ALKQ9UM73 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ALKQ9UM73 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ALKQ9UM73 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ALKQ9UM73 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ALKQ9UM73 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ALKQ9UM73 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ALKQ9UM73 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ALKQ9UM73 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ALKQ9UM73 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
ALKQ9UM73 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ALKQ9UM73 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ALKQ9UM73 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ALKQ9UM73 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ALKQ9UM73 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ALKQ9UM73 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
ALKQ9UM73 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
ALKQ9UM73 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ALKQ9UM73 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ALKQ9UM73 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ALKQ9UM73 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ALKQ9UM73 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ALKQ9UM73 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ALKQ9UM73 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ALKQ9UM73 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ALKQ9UM73 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
ALKQ9UM73 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ALKQ9UM73 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ALKQ9UM73 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ALKQ9UM73 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ALKQ9UM73 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ALKQ9UM73 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
ALKQ9UM73 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ALKQ9UM73 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ALKQ9UM73 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
ALKQ9UM73 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ALKQ9UM73 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms