Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKF7

PITPNC1, Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNC1Q9UKF7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNC1Q9UKF7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNC1Q9UKF7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNC1Q9UKF7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNC1Q9UKF7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNC1Q9UKF7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNC1Q9UKF7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNC1Q9UKF7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNC1Q9UKF7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNC1Q9UKF7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNC1Q9UKF7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNC1Q9UKF7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNC1Q9UKF7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNC1Q9UKF7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNC1Q9UKF7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITPNC1Q9UKF7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNC1Q9UKF7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNC1Q9UKF7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNC1Q9UKF7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNC1Q9UKF7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNC1Q9UKF7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNC1Q9UKF7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNC1Q9UKF7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNC1Q9UKF7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNC1Q9UKF7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNC1Q9UKF7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNC1Q9UKF7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNC1Q9UKF7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNC1Q9UKF7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNC1Q9UKF7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITPNC1Q9UKF7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PITPNC1Q9UKF7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITPNC1Q9UKF7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITPNC1Q9UKF7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITPNC1Q9UKF7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITPNC1Q9UKF7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITPNC1Q9UKF7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITPNC1Q9UKF7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNC1Q9UKF7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITPNC1Q9UKF7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITPNC1Q9UKF7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITPNC1Q9UKF7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNC1Q9UKF7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNC1Q9UKF7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNC1Q9UKF7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITPNC1Q9UKF7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITPNC1Q9UKF7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNC1Q9UKF7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNC1Q9UKF7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNC1Q9UKF7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNC1Q9UKF7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNC1Q9UKF7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNC1Q9UKF7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNC1Q9UKF7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNC1Q9UKF7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNC1Q9UKF7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNC1Q9UKF7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNC1Q9UKF7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNC1Q9UKF7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNC1Q9UKF7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNC1Q9UKF7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNC1Q9UKF7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITPNC1Q9UKF7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITPNC1Q9UKF7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITPNC1Q9UKF7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITPNC1Q9UKF7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITPNC1Q9UKF7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITPNC1Q9UKF7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITPNC1Q9UKF7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms