Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMS3Q9UJD0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMS3Q9UJD0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMS3Q9UJD0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIMS3Q9UJD0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIMS3Q9UJD0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RIMS3Q9UJD0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIMS3Q9UJD0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMS3Q9UJD0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMS3Q9UJD0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIMS3Q9UJD0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIMS3Q9UJD0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIMS3Q9UJD0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIMS3Q9UJD0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS3Q9UJD0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIMS3Q9UJD0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMS3Q9UJD0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMS3Q9UJD0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMS3Q9UJD0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMS3Q9UJD0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMS3Q9UJD0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIMS3Q9UJD0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIMS3Q9UJD0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RIMS3Q9UJD0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RIMS3Q9UJD0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIMS3Q9UJD0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIMS3Q9UJD0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIMS3Q9UJD0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIMS3Q9UJD0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIMS3Q9UJD0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIMS3Q9UJD0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIMS3Q9UJD0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIMS3Q9UJD0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIMS3Q9UJD0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIMS3Q9UJD0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RIMS3Q9UJD0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMS3Q9UJD0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIMS3Q9UJD0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIMS3Q9UJD0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIMS3Q9UJD0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMS3Q9UJD0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIMS3Q9UJD0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIMS3Q9UJD0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIMS3Q9UJD0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIMS3Q9UJD0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RIMS3Q9UJD0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIMS3Q9UJD0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIMS3Q9UJD0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIMS3Q9UJD0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIMS3Q9UJD0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIMS3Q9UJD0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIMS3Q9UJD0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIMS3Q9UJD0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIMS3Q9UJD0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIMS3Q9UJD0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIMS3Q9UJD0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIMS3Q9UJD0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIMS3Q9UJD0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIMS3Q9UJD0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIMS3Q9UJD0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIMS3Q9UJD0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIMS3Q9UJD0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIMS3Q9UJD0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIMS3Q9UJD0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIMS3Q9UJD0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIMS3Q9UJD0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIMS3Q9UJD0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIMS3Q9UJD0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RIMS3Q9UJD0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIMS3Q9UJD0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIMS3Q9UJD0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIMS3Q9UJD0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIMS3Q9UJD0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIMS3Q9UJD0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIMS3Q9UJD0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIMS3Q9UJD0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIMS3Q9UJD0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIMS3Q9UJD0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIMS3Q9UJD0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIMS3Q9UJD0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIMS3Q9UJD0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIMS3Q9UJD0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIMS3Q9UJD0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIMS3Q9UJD0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIMS3Q9UJD0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIMS3Q9UJD0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIMS3Q9UJD0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIMS3Q9UJD0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIMS3Q9UJD0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIMS3Q9UJD0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIMS3Q9UJD0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIMS3Q9UJD0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIMS3Q9UJD0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIMS3Q9UJD0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIMS3Q9UJD0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIMS3Q9UJD0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIMS3Q9UJD0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIMS3Q9UJD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIMS3Q9UJD0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RIMS3Q9UJD0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms