Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL2Q9UBQ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL2Q9UBQ6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL2Q9UBQ6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL2Q9UBQ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL2Q9UBQ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL2Q9UBQ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXTL2Q9UBQ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXTL2Q9UBQ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXTL2Q9UBQ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXTL2Q9UBQ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXTL2Q9UBQ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL2Q9UBQ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL2Q9UBQ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL2Q9UBQ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL2Q9UBQ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL2Q9UBQ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL2Q9UBQ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL2Q9UBQ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL2Q9UBQ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXTL2Q9UBQ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL2Q9UBQ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXTL2Q9UBQ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL2Q9UBQ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL2Q9UBQ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXTL2Q9UBQ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXTL2Q9UBQ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXTL2Q9UBQ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL2Q9UBQ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL2Q9UBQ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL2Q9UBQ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXTL2Q9UBQ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL2Q9UBQ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL2Q9UBQ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL2Q9UBQ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL2Q9UBQ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXTL2Q9UBQ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL2Q9UBQ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL2Q9UBQ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL2Q9UBQ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXTL2Q9UBQ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL2Q9UBQ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL2Q9UBQ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXTL2Q9UBQ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL2Q9UBQ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL2Q9UBQ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL2Q9UBQ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL2Q9UBQ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXTL2Q9UBQ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL2Q9UBQ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL2Q9UBQ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL2Q9UBQ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL2Q9UBQ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL2Q9UBQ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL2Q9UBQ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXTL2Q9UBQ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXTL2Q9UBQ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXTL2Q9UBQ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXTL2Q9UBQ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXTL2Q9UBQ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL2Q9UBQ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL2Q9UBQ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL2Q9UBQ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL2Q9UBQ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL2Q9UBQ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL2Q9UBQ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL2Q9UBQ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL2Q9UBQ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL2Q9UBQ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXTL2Q9UBQ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL2Q9UBQ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL2Q9UBQ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL2Q9UBQ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL2Q9UBQ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL2Q9UBQ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL2Q9UBQ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL2Q9UBQ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL2Q9UBQ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL2Q9UBQ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL2Q9UBQ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL2Q9UBQ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL2Q9UBQ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXTL2Q9UBQ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXTL2Q9UBQ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXTL2Q9UBQ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL2Q9UBQ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL2Q9UBQ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXTL2Q9UBQ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL2Q9UBQ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL2Q9UBQ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL2Q9UBQ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL2Q9UBQ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL2Q9UBQ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL2Q9UBQ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL2Q9UBQ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXTL2Q9UBQ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL2Q9UBQ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL2Q9UBQ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms