Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3KQ9UBQ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3KQ9UBQ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3KQ9UBQ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3KQ9UBQ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3KQ9UBQ5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3KQ9UBQ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3KQ9UBQ5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3KQ9UBQ5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF3KQ9UBQ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3KQ9UBQ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3KQ9UBQ5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3KQ9UBQ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3KQ9UBQ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3KQ9UBQ5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3KQ9UBQ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3KQ9UBQ5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3KQ9UBQ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3KQ9UBQ5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3KQ9UBQ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3KQ9UBQ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3KQ9UBQ5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3KQ9UBQ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3KQ9UBQ5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3KQ9UBQ5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3KQ9UBQ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3KQ9UBQ5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3KQ9UBQ5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3KQ9UBQ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3KQ9UBQ5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3KQ9UBQ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3KQ9UBQ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3KQ9UBQ5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3KQ9UBQ5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3KQ9UBQ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3KQ9UBQ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3KQ9UBQ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3KQ9UBQ5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EIF3KQ9UBQ5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3KQ9UBQ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3KQ9UBQ5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3KQ9UBQ5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3KQ9UBQ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3KQ9UBQ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3KQ9UBQ5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3KQ9UBQ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3KQ9UBQ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3KQ9UBQ5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3KQ9UBQ5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3KQ9UBQ5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3KQ9UBQ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3KQ9UBQ5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3KQ9UBQ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3KQ9UBQ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3KQ9UBQ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3KQ9UBQ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3KQ9UBQ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3KQ9UBQ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3KQ9UBQ5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3KQ9UBQ5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3KQ9UBQ5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3KQ9UBQ5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3KQ9UBQ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3KQ9UBQ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3KQ9UBQ5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3KQ9UBQ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3KQ9UBQ5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3KQ9UBQ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3KQ9UBQ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3KQ9UBQ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3KQ9UBQ5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3KQ9UBQ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3KQ9UBQ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3KQ9UBQ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3KQ9UBQ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3KQ9UBQ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3KQ9UBQ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3KQ9UBQ5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF3KQ9UBQ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3KQ9UBQ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3KQ9UBQ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3KQ9UBQ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3KQ9UBQ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3KQ9UBQ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3KQ9UBQ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3KQ9UBQ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3KQ9UBQ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3KQ9UBQ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms