Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VPS18Q9P253 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS18Q9P253 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS18Q9P253 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS18Q9P253 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS18Q9P253 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS18Q9P253 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VPS18Q9P253 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VPS18Q9P253 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VPS18Q9P253 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VPS18Q9P253 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VPS18Q9P253 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS18Q9P253 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS18Q9P253 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VPS18Q9P253 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS18Q9P253 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
VPS18Q9P253 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VPS18Q9P253 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VPS18Q9P253 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS18Q9P253 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS18Q9P253 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VPS18Q9P253 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VPS18Q9P253 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS18Q9P253 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS18Q9P253 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VPS18Q9P253 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VPS18Q9P253 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VPS18Q9P253 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS18Q9P253 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS18Q9P253 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS18Q9P253 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS18Q9P253 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS18Q9P253 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS18Q9P253 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS18Q9P253 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
VPS18Q9P253 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS18Q9P253 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VPS18Q9P253 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VPS18Q9P253 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VPS18Q9P253 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS18Q9P253 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS18Q9P253 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS18Q9P253 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
VPS18Q9P253 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VPS18Q9P253 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VPS18Q9P253 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS18Q9P253 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS18Q9P253 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS18Q9P253 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
VPS18Q9P253 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VPS18Q9P253 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS18Q9P253 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS18Q9P253 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS18Q9P253 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS18Q9P253 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
VPS18Q9P253 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS18Q9P253 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS18Q9P253 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS18Q9P253 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS18Q9P253 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS18Q9P253 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS18Q9P253 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS18Q9P253 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS18Q9P253 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS18Q9P253 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS18Q9P253 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS18Q9P253 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS18Q9P253 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS18Q9P253 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS18Q9P253 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS18Q9P253 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS18Q9P253 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS18Q9P253 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS18Q9P253 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS18Q9P253 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS18Q9P253 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS18Q9P253 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS18Q9P253 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS18Q9P253 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS18Q9P253 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS18Q9P253 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS18Q9P253 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS18Q9P253 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS18Q9P253 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS18Q9P253 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS18Q9P253 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS18Q9P253 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS18Q9P253 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS18Q9P253 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VPS18Q9P253 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms