Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC88CQ9P219 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC88CQ9P219 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC88CQ9P219 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC88CQ9P219 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC88CQ9P219 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC88CQ9P219 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC88CQ9P219 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC88CQ9P219 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC88CQ9P219 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC88CQ9P219 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC88CQ9P219 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC88CQ9P219 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC88CQ9P219 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC88CQ9P219 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC88CQ9P219 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC88CQ9P219 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC88CQ9P219 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC88CQ9P219 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC88CQ9P219 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC88CQ9P219 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC88CQ9P219 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC88CQ9P219 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC88CQ9P219 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC88CQ9P219 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC88CQ9P219 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC88CQ9P219 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC88CQ9P219 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC88CQ9P219 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC88CQ9P219 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC88CQ9P219 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC88CQ9P219 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC88CQ9P219 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC88CQ9P219 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC88CQ9P219 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC88CQ9P219 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC88CQ9P219 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC88CQ9P219 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC88CQ9P219 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC88CQ9P219 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC88CQ9P219 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC88CQ9P219 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC88CQ9P219 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC88CQ9P219 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC88CQ9P219 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC88CQ9P219 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC88CQ9P219 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC88CQ9P219 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC88CQ9P219 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC88CQ9P219 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC88CQ9P219 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC88CQ9P219 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC88CQ9P219 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC88CQ9P219 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC88CQ9P219 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC88CQ9P219 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC88CQ9P219 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC88CQ9P219 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC88CQ9P219 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC88CQ9P219 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC88CQ9P219 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC88CQ9P219 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC88CQ9P219 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC88CQ9P219 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC88CQ9P219 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC88CQ9P219 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC88CQ9P219 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC88CQ9P219 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC88CQ9P219 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC88CQ9P219 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC88CQ9P219 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC88CQ9P219 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC88CQ9P219 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC88CQ9P219 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC88CQ9P219 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC88CQ9P219 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC88CQ9P219 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC88CQ9P219 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms