Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD9Q9P000 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD9Q9P000 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COMMD9Q9P000 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD9Q9P000 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD9Q9P000 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD9Q9P000 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COMMD9Q9P000 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD9Q9P000 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD9Q9P000 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD9Q9P000 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD9Q9P000 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COMMD9Q9P000 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COMMD9Q9P000 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COMMD9Q9P000 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COMMD9Q9P000 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD9Q9P000 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms