Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD9Q9P000 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD9Q9P000 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COMMD9Q9P000 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COMMD9Q9P000 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD9Q9P000 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD9Q9P000 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD9Q9P000 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD9Q9P000 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COMMD9Q9P000 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COMMD9Q9P000 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD9Q9P000 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD9Q9P000 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD9Q9P000 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD9Q9P000 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD9Q9P000 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COMMD9Q9P000 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COMMD9Q9P000 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COMMD9Q9P000 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COMMD9Q9P000 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD9Q9P000 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD9Q9P000 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD9Q9P000 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COMMD9Q9P000 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD9Q9P000 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD9Q9P000 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COMMD9Q9P000 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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