Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ITSN2Q9NZM3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
ITSN2Q9NZM3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
ITSN2Q9NZM3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
ITSN2Q9NZM3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ITSN2Q9NZM3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
ITSN2Q9NZM3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
ITSN2Q9NZM3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ITSN2Q9NZM3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ITSN2Q9NZM3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
ITSN2Q9NZM3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
ITSN2Q9NZM3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ITSN2Q9NZM3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ITSN2Q9NZM3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ITSN2Q9NZM3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
ITSN2Q9NZM3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ITSN2Q9NZM3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ITSN2Q9NZM3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
ITSN2Q9NZM3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
ITSN2Q9NZM3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
ITSN2Q9NZM3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
ITSN2Q9NZM3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
ITSN2Q9NZM3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
ITSN2Q9NZM3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
ITSN2Q9NZM3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
ITSN2Q9NZM3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ITSN2Q9NZM3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ITSN2Q9NZM3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ITSN2Q9NZM3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ITSN2Q9NZM3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
ITSN2Q9NZM3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ITSN2Q9NZM3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ITSN2Q9NZM3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ITSN2Q9NZM3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
ITSN2Q9NZM3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ITSN2Q9NZM3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
ITSN2Q9NZM3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ITSN2Q9NZM3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ITSN2Q9NZM3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
ITSN2Q9NZM3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ITSN2Q9NZM3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ITSN2Q9NZM3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ITSN2Q9NZM3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
ITSN2Q9NZM3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
ITSN2Q9NZM3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
ITSN2Q9NZM3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
ITSN2Q9NZM3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ITSN2Q9NZM3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
ITSN2Q9NZM3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
ITSN2Q9NZM3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ITSN2Q9NZM3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ITSN2Q9NZM3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
ITSN2Q9NZM3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
ITSN2Q9NZM3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
ITSN2Q9NZM3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
ITSN2Q9NZM3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
ITSN2Q9NZM3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
ITSN2Q9NZM3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
ITSN2Q9NZM3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ITSN2Q9NZM3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ITSN2Q9NZM3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ITSN2Q9NZM3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
ITSN2Q9NZM3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ITSN2Q9NZM3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
ITSN2Q9NZM3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ITSN2Q9NZM3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ITSN2Q9NZM3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
ITSN2Q9NZM3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
ITSN2Q9NZM3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
ITSN2Q9NZM3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
ITSN2Q9NZM3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
ITSN2Q9NZM3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ITSN2Q9NZM3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ITSN2Q9NZM3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.78■■■■■ 4.6
ITSN2Q9NZM3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
ITSN2Q9NZM3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
ITSN2Q9NZM3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
ITSN2Q9NZM3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
ITSN2Q9NZM3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.65■■■■■ 4.58
ITSN2Q9NZM3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ITSN2Q9NZM3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
ITSN2Q9NZM3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
ITSN2Q9NZM3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
ITSN2Q9NZM3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
ITSN2Q9NZM3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
ITSN2Q9NZM3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
ITSN2Q9NZM3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ITSN2Q9NZM3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ITSN2Q9NZM3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ITSN2Q9NZM3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ITSN2Q9NZM3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
ITSN2Q9NZM3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ITSN2Q9NZM3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ITSN2Q9NZM3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ITSN2Q9NZM3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ITSN2Q9NZM3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
ITSN2Q9NZM3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
ITSN2Q9NZM3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
ITSN2Q9NZM3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
ITSN2Q9NZM3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms