Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYOFQ9NZM1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOFQ9NZM1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOFQ9NZM1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOFQ9NZM1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MYOFQ9NZM1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MYOFQ9NZM1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYOFQ9NZM1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYOFQ9NZM1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYOFQ9NZM1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYOFQ9NZM1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MYOFQ9NZM1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MYOFQ9NZM1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MYOFQ9NZM1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MYOFQ9NZM1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MYOFQ9NZM1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MYOFQ9NZM1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MYOFQ9NZM1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MYOFQ9NZM1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYOFQ9NZM1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYOFQ9NZM1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MYOFQ9NZM1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYOFQ9NZM1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYOFQ9NZM1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYOFQ9NZM1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYOFQ9NZM1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MYOFQ9NZM1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYOFQ9NZM1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MYOFQ9NZM1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYOFQ9NZM1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MYOFQ9NZM1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYOFQ9NZM1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYOFQ9NZM1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYOFQ9NZM1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYOFQ9NZM1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYOFQ9NZM1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYOFQ9NZM1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYOFQ9NZM1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MYOFQ9NZM1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYOFQ9NZM1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MYOFQ9NZM1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYOFQ9NZM1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MYOFQ9NZM1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYOFQ9NZM1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOFQ9NZM1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOFQ9NZM1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOFQ9NZM1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOFQ9NZM1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOFQ9NZM1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MYOFQ9NZM1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOFQ9NZM1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOFQ9NZM1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYOFQ9NZM1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYOFQ9NZM1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYOFQ9NZM1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYOFQ9NZM1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYOFQ9NZM1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYOFQ9NZM1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYOFQ9NZM1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MYOFQ9NZM1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYOFQ9NZM1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYOFQ9NZM1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYOFQ9NZM1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYOFQ9NZM1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYOFQ9NZM1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYOFQ9NZM1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MYOFQ9NZM1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYOFQ9NZM1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYOFQ9NZM1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYOFQ9NZM1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYOFQ9NZM1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
MYOFQ9NZM1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYOFQ9NZM1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYOFQ9NZM1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYOFQ9NZM1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYOFQ9NZM1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYOFQ9NZM1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYOFQ9NZM1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYOFQ9NZM1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYOFQ9NZM1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYOFQ9NZM1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYOFQ9NZM1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYOFQ9NZM1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYOFQ9NZM1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYOFQ9NZM1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYOFQ9NZM1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYOFQ9NZM1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYOFQ9NZM1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MYOFQ9NZM1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYOFQ9NZM1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
MYOFQ9NZM1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYOFQ9NZM1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYOFQ9NZM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYOFQ9NZM1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYOFQ9NZM1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYOFQ9NZM1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYOFQ9NZM1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYOFQ9NZM1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYOFQ9NZM1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYOFQ9NZM1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms