Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SACSQ9NZJ4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SACSQ9NZJ4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SACSQ9NZJ4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SACSQ9NZJ4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SACSQ9NZJ4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SACSQ9NZJ4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SACSQ9NZJ4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SACSQ9NZJ4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SACSQ9NZJ4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SACSQ9NZJ4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SACSQ9NZJ4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SACSQ9NZJ4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SACSQ9NZJ4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SACSQ9NZJ4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SACSQ9NZJ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SACSQ9NZJ4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SACSQ9NZJ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SACSQ9NZJ4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SACSQ9NZJ4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SACSQ9NZJ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SACSQ9NZJ4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SACSQ9NZJ4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SACSQ9NZJ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SACSQ9NZJ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SACSQ9NZJ4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SACSQ9NZJ4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SACSQ9NZJ4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SACSQ9NZJ4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SACSQ9NZJ4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SACSQ9NZJ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SACSQ9NZJ4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SACSQ9NZJ4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SACSQ9NZJ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SACSQ9NZJ4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SACSQ9NZJ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SACSQ9NZJ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SACSQ9NZJ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SACSQ9NZJ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SACSQ9NZJ4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SACSQ9NZJ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SACSQ9NZJ4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SACSQ9NZJ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SACSQ9NZJ4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SACSQ9NZJ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SACSQ9NZJ4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SACSQ9NZJ4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SACSQ9NZJ4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SACSQ9NZJ4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SACSQ9NZJ4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SACSQ9NZJ4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SACSQ9NZJ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SACSQ9NZJ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SACSQ9NZJ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SACSQ9NZJ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SACSQ9NZJ4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SACSQ9NZJ4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SACSQ9NZJ4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SACSQ9NZJ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SACSQ9NZJ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SACSQ9NZJ4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SACSQ9NZJ4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SACSQ9NZJ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SACSQ9NZJ4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SACSQ9NZJ4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SACSQ9NZJ4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SACSQ9NZJ4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SACSQ9NZJ4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SACSQ9NZJ4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SACSQ9NZJ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SACSQ9NZJ4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SACSQ9NZJ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SACSQ9NZJ4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SACSQ9NZJ4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SACSQ9NZJ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SACSQ9NZJ4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SACSQ9NZJ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SACSQ9NZJ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SACSQ9NZJ4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SACSQ9NZJ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SACSQ9NZJ4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SACSQ9NZJ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SACSQ9NZJ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SACSQ9NZJ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SACSQ9NZJ4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SACSQ9NZJ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SACSQ9NZJ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SACSQ9NZJ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SACSQ9NZJ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SACSQ9NZJ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms