Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMPD3Q9NY59 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMPD3Q9NY59 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD3Q9NY59 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD3Q9NY59 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD3Q9NY59 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD3Q9NY59 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPD3Q9NY59 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMPD3Q9NY59 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD3Q9NY59 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD3Q9NY59 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD3Q9NY59 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPD3Q9NY59 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPD3Q9NY59 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMPD3Q9NY59 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMPD3Q9NY59 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMPD3Q9NY59 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMPD3Q9NY59 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPD3Q9NY59 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPD3Q9NY59 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMPD3Q9NY59 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMPD3Q9NY59 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMPD3Q9NY59 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMPD3Q9NY59 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMPD3Q9NY59 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMPD3Q9NY59 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPD3Q9NY59 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPD3Q9NY59 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD3Q9NY59 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMPD3Q9NY59 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMPD3Q9NY59 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD3Q9NY59 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD3Q9NY59 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD3Q9NY59 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD3Q9NY59 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPD3Q9NY59 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPD3Q9NY59 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPD3Q9NY59 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPD3Q9NY59 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMPD3Q9NY59 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPD3Q9NY59 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPD3Q9NY59 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPD3Q9NY59 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPD3Q9NY59 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMPD3Q9NY59 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMPD3Q9NY59 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMPD3Q9NY59 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMPD3Q9NY59 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMPD3Q9NY59 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMPD3Q9NY59 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMPD3Q9NY59 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMPD3Q9NY59 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD3Q9NY59 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPD3Q9NY59 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMPD3Q9NY59 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMPD3Q9NY59 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMPD3Q9NY59 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMPD3Q9NY59 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMPD3Q9NY59 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMPD3Q9NY59 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMPD3Q9NY59 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD3Q9NY59 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD3Q9NY59 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMPD3Q9NY59 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMPD3Q9NY59 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMPD3Q9NY59 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMPD3Q9NY59 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMPD3Q9NY59 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMPD3Q9NY59 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD3Q9NY59 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMPD3Q9NY59 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMPD3Q9NY59 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMPD3Q9NY59 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD3Q9NY59 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD3Q9NY59 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD3Q9NY59 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD3Q9NY59 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD3Q9NY59 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMPD3Q9NY59 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMPD3Q9NY59 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD3Q9NY59 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMPD3Q9NY59 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD3Q9NY59 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD3Q9NY59 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD3Q9NY59 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD3Q9NY59 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD3Q9NY59 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD3Q9NY59 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMPD3Q9NY59 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMPD3Q9NY59 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD3Q9NY59 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD3Q9NY59 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD3Q9NY59 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD3Q9NY59 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMPD3Q9NY59 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD3Q9NY59 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMPD3Q9NY59 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMPD3Q9NY59 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMPD3Q9NY59 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMPD3Q9NY59 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms