Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
CNTLNQ9NXG0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CNTLNQ9NXG0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CNTLNQ9NXG0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CNTLNQ9NXG0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
CNTLNQ9NXG0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.19■■■■■ 4.66
CNTLNQ9NXG0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
CNTLNQ9NXG0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CNTLNQ9NXG0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
CNTLNQ9NXG0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
CNTLNQ9NXG0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
CNTLNQ9NXG0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
CNTLNQ9NXG0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CNTLNQ9NXG0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CNTLNQ9NXG0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
CNTLNQ9NXG0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CNTLNQ9NXG0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
CNTLNQ9NXG0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.72■■■■■ 4.59
CNTLNQ9NXG0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
CNTLNQ9NXG0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
CNTLNQ9NXG0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
CNTLNQ9NXG0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
CNTLNQ9NXG0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
CNTLNQ9NXG0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
CNTLNQ9NXG0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
CNTLNQ9NXG0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CNTLNQ9NXG0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
CNTLNQ9NXG0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CNTLNQ9NXG0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CNTLNQ9NXG0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
CNTLNQ9NXG0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CNTLNQ9NXG0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CNTLNQ9NXG0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CNTLNQ9NXG0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CNTLNQ9NXG0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CNTLNQ9NXG0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CNTLNQ9NXG0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CNTLNQ9NXG0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CNTLNQ9NXG0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CNTLNQ9NXG0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CNTLNQ9NXG0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CNTLNQ9NXG0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CNTLNQ9NXG0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CNTLNQ9NXG0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CNTLNQ9NXG0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CNTLNQ9NXG0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CNTLNQ9NXG0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CNTLNQ9NXG0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CNTLNQ9NXG0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CNTLNQ9NXG0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CNTLNQ9NXG0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CNTLNQ9NXG0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
CNTLNQ9NXG0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CNTLNQ9NXG0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CNTLNQ9NXG0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CNTLNQ9NXG0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CNTLNQ9NXG0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CNTLNQ9NXG0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CNTLNQ9NXG0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CNTLNQ9NXG0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CNTLNQ9NXG0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
CNTLNQ9NXG0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CNTLNQ9NXG0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CNTLNQ9NXG0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CNTLNQ9NXG0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CNTLNQ9NXG0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CNTLNQ9NXG0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CNTLNQ9NXG0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CNTLNQ9NXG0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
CNTLNQ9NXG0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CNTLNQ9NXG0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CNTLNQ9NXG0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
CNTLNQ9NXG0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CNTLNQ9NXG0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CNTLNQ9NXG0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CNTLNQ9NXG0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CNTLNQ9NXG0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CNTLNQ9NXG0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CNTLNQ9NXG0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CNTLNQ9NXG0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CNTLNQ9NXG0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CNTLNQ9NXG0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CNTLNQ9NXG0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CNTLNQ9NXG0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
CNTLNQ9NXG0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CNTLNQ9NXG0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CNTLNQ9NXG0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CNTLNQ9NXG0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
CNTLNQ9NXG0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CNTLNQ9NXG0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CNTLNQ9NXG0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CNTLNQ9NXG0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CNTLNQ9NXG0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CNTLNQ9NXG0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CNTLNQ9NXG0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CNTLNQ9NXG0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CNTLNQ9NXG0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
CNTLNQ9NXG0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CNTLNQ9NXG0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CNTLNQ9NXG0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms