Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHP2Q9NX24 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHP2Q9NX24 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHP2Q9NX24 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHP2Q9NX24 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHP2Q9NX24 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHP2Q9NX24 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHP2Q9NX24 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHP2Q9NX24 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHP2Q9NX24 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NHP2Q9NX24 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHP2Q9NX24 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHP2Q9NX24 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHP2Q9NX24 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHP2Q9NX24 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHP2Q9NX24 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NHP2Q9NX24 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHP2Q9NX24 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHP2Q9NX24 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHP2Q9NX24 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHP2Q9NX24 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHP2Q9NX24 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHP2Q9NX24 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHP2Q9NX24 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHP2Q9NX24 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHP2Q9NX24 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHP2Q9NX24 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHP2Q9NX24 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHP2Q9NX24 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHP2Q9NX24 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHP2Q9NX24 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHP2Q9NX24 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHP2Q9NX24 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHP2Q9NX24 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHP2Q9NX24 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHP2Q9NX24 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHP2Q9NX24 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NHP2Q9NX24 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NHP2Q9NX24 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHP2Q9NX24 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NHP2Q9NX24 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NHP2Q9NX24 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NHP2Q9NX24 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NHP2Q9NX24 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NHP2Q9NX24 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NHP2Q9NX24 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NHP2Q9NX24 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NHP2Q9NX24 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NHP2Q9NX24 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NHP2Q9NX24 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NHP2Q9NX24 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NHP2Q9NX24 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NHP2Q9NX24 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NHP2Q9NX24 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NHP2Q9NX24 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NHP2Q9NX24 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NHP2Q9NX24 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHP2Q9NX24 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHP2Q9NX24 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NHP2Q9NX24 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHP2Q9NX24 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHP2Q9NX24 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NHP2Q9NX24 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NHP2Q9NX24 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NHP2Q9NX24 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHP2Q9NX24 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHP2Q9NX24 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NHP2Q9NX24 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms