Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUC0

SERTAD4, SERTA domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERTAD4Q9NUC0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERTAD4Q9NUC0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERTAD4Q9NUC0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERTAD4Q9NUC0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERTAD4Q9NUC0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERTAD4Q9NUC0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERTAD4Q9NUC0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERTAD4Q9NUC0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERTAD4Q9NUC0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERTAD4Q9NUC0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERTAD4Q9NUC0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERTAD4Q9NUC0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERTAD4Q9NUC0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERTAD4Q9NUC0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERTAD4Q9NUC0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERTAD4Q9NUC0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERTAD4Q9NUC0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERTAD4Q9NUC0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERTAD4Q9NUC0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERTAD4Q9NUC0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SERTAD4Q9NUC0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERTAD4Q9NUC0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERTAD4Q9NUC0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERTAD4Q9NUC0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERTAD4Q9NUC0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERTAD4Q9NUC0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERTAD4Q9NUC0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERTAD4Q9NUC0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERTAD4Q9NUC0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERTAD4Q9NUC0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERTAD4Q9NUC0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERTAD4Q9NUC0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERTAD4Q9NUC0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERTAD4Q9NUC0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERTAD4Q9NUC0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERTAD4Q9NUC0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERTAD4Q9NUC0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERTAD4Q9NUC0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERTAD4Q9NUC0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERTAD4Q9NUC0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SERTAD4Q9NUC0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERTAD4Q9NUC0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERTAD4Q9NUC0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERTAD4Q9NUC0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERTAD4Q9NUC0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERTAD4Q9NUC0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERTAD4Q9NUC0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERTAD4Q9NUC0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERTAD4Q9NUC0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERTAD4Q9NUC0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERTAD4Q9NUC0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERTAD4Q9NUC0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERTAD4Q9NUC0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERTAD4Q9NUC0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERTAD4Q9NUC0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERTAD4Q9NUC0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERTAD4Q9NUC0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERTAD4Q9NUC0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERTAD4Q9NUC0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERTAD4Q9NUC0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERTAD4Q9NUC0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERTAD4Q9NUC0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERTAD4Q9NUC0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERTAD4Q9NUC0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERTAD4Q9NUC0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERTAD4Q9NUC0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERTAD4Q9NUC0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERTAD4Q9NUC0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERTAD4Q9NUC0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERTAD4Q9NUC0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERTAD4Q9NUC0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERTAD4Q9NUC0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERTAD4Q9NUC0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERTAD4Q9NUC0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERTAD4Q9NUC0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERTAD4Q9NUC0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERTAD4Q9NUC0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERTAD4Q9NUC0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERTAD4Q9NUC0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SERTAD4Q9NUC0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERTAD4Q9NUC0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERTAD4Q9NUC0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERTAD4Q9NUC0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERTAD4Q9NUC0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERTAD4Q9NUC0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERTAD4Q9NUC0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERTAD4Q9NUC0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERTAD4Q9NUC0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms