Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYRM2Q9NU23 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYRM2Q9NU23 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYRM2Q9NU23 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYRM2Q9NU23 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYRM2Q9NU23 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LYRM2Q9NU23 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYRM2Q9NU23 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYRM2Q9NU23 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYRM2Q9NU23 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYRM2Q9NU23 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LYRM2Q9NU23 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYRM2Q9NU23 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYRM2Q9NU23 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYRM2Q9NU23 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYRM2Q9NU23 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYRM2Q9NU23 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYRM2Q9NU23 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYRM2Q9NU23 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYRM2Q9NU23 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYRM2Q9NU23 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYRM2Q9NU23 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYRM2Q9NU23 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYRM2Q9NU23 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYRM2Q9NU23 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYRM2Q9NU23 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYRM2Q9NU23 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYRM2Q9NU23 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYRM2Q9NU23 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LYRM2Q9NU23 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYRM2Q9NU23 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LYRM2Q9NU23 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYRM2Q9NU23 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYRM2Q9NU23 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYRM2Q9NU23 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYRM2Q9NU23 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYRM2Q9NU23 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYRM2Q9NU23 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYRM2Q9NU23 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYRM2Q9NU23 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYRM2Q9NU23 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYRM2Q9NU23 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYRM2Q9NU23 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYRM2Q9NU23 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYRM2Q9NU23 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYRM2Q9NU23 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYRM2Q9NU23 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYRM2Q9NU23 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYRM2Q9NU23 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYRM2Q9NU23 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYRM2Q9NU23 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYRM2Q9NU23 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYRM2Q9NU23 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYRM2Q9NU23 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYRM2Q9NU23 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM2Q9NU23 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYRM2Q9NU23 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM2Q9NU23 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM2Q9NU23 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM2Q9NU23 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM2Q9NU23 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM2Q9NU23 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM2Q9NU23 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM2Q9NU23 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYRM2Q9NU23 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM2Q9NU23 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LYRM2Q9NU23 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LYRM2Q9NU23 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYRM2Q9NU23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYRM2Q9NU23 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM2Q9NU23 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM2Q9NU23 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM2Q9NU23 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYRM2Q9NU23 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYRM2Q9NU23 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYRM2Q9NU23 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYRM2Q9NU23 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYRM2Q9NU23 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYRM2Q9NU23 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYRM2Q9NU23 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYRM2Q9NU23 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYRM2Q9NU23 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYRM2Q9NU23 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYRM2Q9NU23 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYRM2Q9NU23 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYRM2Q9NU23 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYRM2Q9NU23 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYRM2Q9NU23 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYRM2Q9NU23 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYRM2Q9NU23 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms