Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMCO4Q9NRQ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMCO4Q9NRQ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMCO4Q9NRQ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMCO4Q9NRQ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMCO4Q9NRQ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMCO4Q9NRQ5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMCO4Q9NRQ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMCO4Q9NRQ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMCO4Q9NRQ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMCO4Q9NRQ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMCO4Q9NRQ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMCO4Q9NRQ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMCO4Q9NRQ5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMCO4Q9NRQ5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMCO4Q9NRQ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMCO4Q9NRQ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMCO4Q9NRQ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMCO4Q9NRQ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMCO4Q9NRQ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMCO4Q9NRQ5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMCO4Q9NRQ5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMCO4Q9NRQ5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO4Q9NRQ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO4Q9NRQ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO4Q9NRQ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMCO4Q9NRQ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMCO4Q9NRQ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMCO4Q9NRQ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMCO4Q9NRQ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMCO4Q9NRQ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMCO4Q9NRQ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMCO4Q9NRQ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMCO4Q9NRQ5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMCO4Q9NRQ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMCO4Q9NRQ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMCO4Q9NRQ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMCO4Q9NRQ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMCO4Q9NRQ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMCO4Q9NRQ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMCO4Q9NRQ5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMCO4Q9NRQ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMCO4Q9NRQ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMCO4Q9NRQ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMCO4Q9NRQ5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMCO4Q9NRQ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMCO4Q9NRQ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMCO4Q9NRQ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMCO4Q9NRQ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMCO4Q9NRQ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMCO4Q9NRQ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMCO4Q9NRQ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMCO4Q9NRQ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMCO4Q9NRQ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMCO4Q9NRQ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMCO4Q9NRQ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMCO4Q9NRQ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMCO4Q9NRQ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMCO4Q9NRQ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMCO4Q9NRQ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMCO4Q9NRQ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMCO4Q9NRQ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMCO4Q9NRQ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMCO4Q9NRQ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMCO4Q9NRQ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMCO4Q9NRQ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms