Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BATF3Q9NR55 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BATF3Q9NR55 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BATF3Q9NR55 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BATF3Q9NR55 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BATF3Q9NR55 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BATF3Q9NR55 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BATF3Q9NR55 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BATF3Q9NR55 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BATF3Q9NR55 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BATF3Q9NR55 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BATF3Q9NR55 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BATF3Q9NR55 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BATF3Q9NR55 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BATF3Q9NR55 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BATF3Q9NR55 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BATF3Q9NR55 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BATF3Q9NR55 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BATF3Q9NR55 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BATF3Q9NR55 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BATF3Q9NR55 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BATF3Q9NR55 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BATF3Q9NR55 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BATF3Q9NR55 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BATF3Q9NR55 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BATF3Q9NR55 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BATF3Q9NR55 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BATF3Q9NR55 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BATF3Q9NR55 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BATF3Q9NR55 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BATF3Q9NR55 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BATF3Q9NR55 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BATF3Q9NR55 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BATF3Q9NR55 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BATF3Q9NR55 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BATF3Q9NR55 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BATF3Q9NR55 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BATF3Q9NR55 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BATF3Q9NR55 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BATF3Q9NR55 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BATF3Q9NR55 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BATF3Q9NR55 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BATF3Q9NR55 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BATF3Q9NR55 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BATF3Q9NR55 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BATF3Q9NR55 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BATF3Q9NR55 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BATF3Q9NR55 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BATF3Q9NR55 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BATF3Q9NR55 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BATF3Q9NR55 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BATF3Q9NR55 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BATF3Q9NR55 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BATF3Q9NR55 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BATF3Q9NR55 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BATF3Q9NR55 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BATF3Q9NR55 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BATF3Q9NR55 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BATF3Q9NR55 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BATF3Q9NR55 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BATF3Q9NR55 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BATF3Q9NR55 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BATF3Q9NR55 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BATF3Q9NR55 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BATF3Q9NR55 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BATF3Q9NR55 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BATF3Q9NR55 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BATF3Q9NR55 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BATF3Q9NR55 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BATF3Q9NR55 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BATF3Q9NR55 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BATF3Q9NR55 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BATF3Q9NR55 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BATF3Q9NR55 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BATF3Q9NR55 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BATF3Q9NR55 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BATF3Q9NR55 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BATF3Q9NR55 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BATF3Q9NR55 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BATF3Q9NR55 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BATF3Q9NR55 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BATF3Q9NR55 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BATF3Q9NR55 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BATF3Q9NR55 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BATF3Q9NR55 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BATF3Q9NR55 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BATF3Q9NR55 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BATF3Q9NR55 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms