Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRDM10Q9NQV6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM10Q9NQV6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRDM10Q9NQV6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PRDM10Q9NQV6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRDM10Q9NQV6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRDM10Q9NQV6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRDM10Q9NQV6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRDM10Q9NQV6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM10Q9NQV6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PRDM10Q9NQV6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRDM10Q9NQV6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM10Q9NQV6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRDM10Q9NQV6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRDM10Q9NQV6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM10Q9NQV6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM10Q9NQV6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRDM10Q9NQV6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRDM10Q9NQV6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM10Q9NQV6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM10Q9NQV6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM10Q9NQV6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM10Q9NQV6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRDM10Q9NQV6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM10Q9NQV6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRDM10Q9NQV6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRDM10Q9NQV6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM10Q9NQV6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM10Q9NQV6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM10Q9NQV6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM10Q9NQV6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRDM10Q9NQV6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM10Q9NQV6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM10Q9NQV6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM10Q9NQV6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM10Q9NQV6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM10Q9NQV6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM10Q9NQV6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM10Q9NQV6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRDM10Q9NQV6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM10Q9NQV6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM10Q9NQV6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM10Q9NQV6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM10Q9NQV6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM10Q9NQV6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM10Q9NQV6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PRDM10Q9NQV6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM10Q9NQV6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM10Q9NQV6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM10Q9NQV6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM10Q9NQV6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM10Q9NQV6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM10Q9NQV6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRDM10Q9NQV6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM10Q9NQV6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM10Q9NQV6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM10Q9NQV6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRDM10Q9NQV6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRDM10Q9NQV6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRDM10Q9NQV6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM10Q9NQV6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM10Q9NQV6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM10Q9NQV6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM10Q9NQV6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM10Q9NQV6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRDM10Q9NQV6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRDM10Q9NQV6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRDM10Q9NQV6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRDM10Q9NQV6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM10Q9NQV6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM10Q9NQV6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM10Q9NQV6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM10Q9NQV6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM10Q9NQV6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM10Q9NQV6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRDM10Q9NQV6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRDM10Q9NQV6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRDM10Q9NQV6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRDM10Q9NQV6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM10Q9NQV6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRDM10Q9NQV6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRDM10Q9NQV6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PRDM10Q9NQV6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PRDM10Q9NQV6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PRDM10Q9NQV6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRDM10Q9NQV6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM10Q9NQV6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM10Q9NQV6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRDM10Q9NQV6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM10Q9NQV6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM10Q9NQV6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM10Q9NQV6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM10Q9NQV6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRDM10Q9NQV6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM10Q9NQV6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM10Q9NQV6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM10Q9NQV6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM10Q9NQV6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM10Q9NQV6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM10Q9NQV6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms