Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIT2Q9NQR4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIT2Q9NQR4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIT2Q9NQR4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIT2Q9NQR4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIT2Q9NQR4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIT2Q9NQR4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIT2Q9NQR4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIT2Q9NQR4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIT2Q9NQR4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIT2Q9NQR4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIT2Q9NQR4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIT2Q9NQR4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIT2Q9NQR4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIT2Q9NQR4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIT2Q9NQR4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIT2Q9NQR4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIT2Q9NQR4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIT2Q9NQR4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIT2Q9NQR4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIT2Q9NQR4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NIT2Q9NQR4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIT2Q9NQR4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIT2Q9NQR4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIT2Q9NQR4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIT2Q9NQR4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIT2Q9NQR4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIT2Q9NQR4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIT2Q9NQR4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIT2Q9NQR4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIT2Q9NQR4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIT2Q9NQR4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIT2Q9NQR4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIT2Q9NQR4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIT2Q9NQR4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIT2Q9NQR4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIT2Q9NQR4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIT2Q9NQR4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIT2Q9NQR4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIT2Q9NQR4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIT2Q9NQR4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIT2Q9NQR4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIT2Q9NQR4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIT2Q9NQR4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIT2Q9NQR4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIT2Q9NQR4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIT2Q9NQR4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIT2Q9NQR4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIT2Q9NQR4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIT2Q9NQR4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIT2Q9NQR4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIT2Q9NQR4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIT2Q9NQR4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIT2Q9NQR4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIT2Q9NQR4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIT2Q9NQR4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIT2Q9NQR4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIT2Q9NQR4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIT2Q9NQR4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIT2Q9NQR4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIT2Q9NQR4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIT2Q9NQR4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIT2Q9NQR4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIT2Q9NQR4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIT2Q9NQR4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIT2Q9NQR4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIT2Q9NQR4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIT2Q9NQR4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIT2Q9NQR4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIT2Q9NQR4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIT2Q9NQR4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIT2Q9NQR4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIT2Q9NQR4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIT2Q9NQR4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms