Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREM1Q9NP99 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREM1Q9NP99 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREM1Q9NP99 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREM1Q9NP99 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREM1Q9NP99 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREM1Q9NP99 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREM1Q9NP99 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREM1Q9NP99 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREM1Q9NP99 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREM1Q9NP99 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TREM1Q9NP99 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREM1Q9NP99 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREM1Q9NP99 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREM1Q9NP99 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREM1Q9NP99 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREM1Q9NP99 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREM1Q9NP99 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREM1Q9NP99 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREM1Q9NP99 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREM1Q9NP99 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREM1Q9NP99 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREM1Q9NP99 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREM1Q9NP99 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TREM1Q9NP99 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREM1Q9NP99 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREM1Q9NP99 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREM1Q9NP99 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREM1Q9NP99 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREM1Q9NP99 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREM1Q9NP99 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREM1Q9NP99 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREM1Q9NP99 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREM1Q9NP99 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREM1Q9NP99 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREM1Q9NP99 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREM1Q9NP99 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREM1Q9NP99 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREM1Q9NP99 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREM1Q9NP99 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREM1Q9NP99 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREM1Q9NP99 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREM1Q9NP99 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREM1Q9NP99 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREM1Q9NP99 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TREM1Q9NP99 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREM1Q9NP99 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREM1Q9NP99 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREM1Q9NP99 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREM1Q9NP99 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREM1Q9NP99 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREM1Q9NP99 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREM1Q9NP99 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREM1Q9NP99 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREM1Q9NP99 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREM1Q9NP99 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREM1Q9NP99 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREM1Q9NP99 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREM1Q9NP99 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREM1Q9NP99 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TREM1Q9NP99 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREM1Q9NP99 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREM1Q9NP99 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREM1Q9NP99 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREM1Q9NP99 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREM1Q9NP99 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREM1Q9NP99 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREM1Q9NP99 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREM1Q9NP99 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREM1Q9NP99 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREM1Q9NP99 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREM1Q9NP99 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREM1Q9NP99 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREM1Q9NP99 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREM1Q9NP99 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREM1Q9NP99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREM1Q9NP99 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREM1Q9NP99 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREM1Q9NP99 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREM1Q9NP99 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREM1Q9NP99 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREM1Q9NP99 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREM1Q9NP99 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREM1Q9NP99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREM1Q9NP99 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREM1Q9NP99 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREM1Q9NP99 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREM1Q9NP99 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREM1Q9NP99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREM1Q9NP99 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREM1Q9NP99 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREM1Q9NP99 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREM1Q9NP99 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREM1Q9NP99 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREM1Q9NP99 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREM1Q9NP99 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREM1Q9NP99 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREM1Q9NP99 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREM1Q9NP99 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREM1Q9NP99 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms