Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC24A3Q9HC58 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC24A3Q9HC58 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC24A3Q9HC58 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC24A3Q9HC58 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC24A3Q9HC58 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC24A3Q9HC58 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC24A3Q9HC58 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC24A3Q9HC58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC24A3Q9HC58 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC24A3Q9HC58 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC24A3Q9HC58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC24A3Q9HC58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC24A3Q9HC58 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC24A3Q9HC58 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC24A3Q9HC58 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC24A3Q9HC58 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC24A3Q9HC58 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC24A3Q9HC58 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC24A3Q9HC58 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC24A3Q9HC58 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC24A3Q9HC58 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC24A3Q9HC58 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC24A3Q9HC58 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC24A3Q9HC58 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC24A3Q9HC58 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC24A3Q9HC58 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC24A3Q9HC58 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC24A3Q9HC58 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC24A3Q9HC58 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC24A3Q9HC58 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC24A3Q9HC58 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC24A3Q9HC58 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC24A3Q9HC58 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC24A3Q9HC58 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC24A3Q9HC58 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC24A3Q9HC58 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC24A3Q9HC58 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC24A3Q9HC58 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC24A3Q9HC58 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC24A3Q9HC58 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC24A3Q9HC58 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC24A3Q9HC58 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC24A3Q9HC58 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC24A3Q9HC58 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC24A3Q9HC58 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC24A3Q9HC58 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC24A3Q9HC58 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC24A3Q9HC58 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC24A3Q9HC58 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC24A3Q9HC58 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC24A3Q9HC58 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC24A3Q9HC58 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC24A3Q9HC58 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC24A3Q9HC58 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC24A3Q9HC58 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC24A3Q9HC58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC24A3Q9HC58 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC24A3Q9HC58 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC24A3Q9HC58 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC24A3Q9HC58 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC24A3Q9HC58 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC24A3Q9HC58 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC24A3Q9HC58 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC24A3Q9HC58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC24A3Q9HC58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC24A3Q9HC58 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC24A3Q9HC58 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC24A3Q9HC58 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC24A3Q9HC58 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC24A3Q9HC58 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC24A3Q9HC58 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC24A3Q9HC58 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC24A3Q9HC58 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC24A3Q9HC58 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC24A3Q9HC58 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC24A3Q9HC58 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC24A3Q9HC58 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC24A3Q9HC58 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC24A3Q9HC58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC24A3Q9HC58 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC24A3Q9HC58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC24A3Q9HC58 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC24A3Q9HC58 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC24A3Q9HC58 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC24A3Q9HC58 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC24A3Q9HC58 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC24A3Q9HC58 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC24A3Q9HC58 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms