Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBT6

CDH20, Cadherin-20, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH20Q9HBT6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH20Q9HBT6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH20Q9HBT6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH20Q9HBT6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH20Q9HBT6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH20Q9HBT6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH20Q9HBT6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH20Q9HBT6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH20Q9HBT6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH20Q9HBT6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH20Q9HBT6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH20Q9HBT6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH20Q9HBT6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH20Q9HBT6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH20Q9HBT6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH20Q9HBT6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH20Q9HBT6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH20Q9HBT6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH20Q9HBT6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH20Q9HBT6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH20Q9HBT6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH20Q9HBT6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH20Q9HBT6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH20Q9HBT6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH20Q9HBT6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH20Q9HBT6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH20Q9HBT6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH20Q9HBT6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH20Q9HBT6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH20Q9HBT6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH20Q9HBT6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH20Q9HBT6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH20Q9HBT6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH20Q9HBT6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH20Q9HBT6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH20Q9HBT6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH20Q9HBT6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH20Q9HBT6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH20Q9HBT6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH20Q9HBT6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH20Q9HBT6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH20Q9HBT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH20Q9HBT6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH20Q9HBT6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH20Q9HBT6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH20Q9HBT6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH20Q9HBT6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH20Q9HBT6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH20Q9HBT6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH20Q9HBT6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH20Q9HBT6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH20Q9HBT6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH20Q9HBT6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH20Q9HBT6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH20Q9HBT6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH20Q9HBT6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH20Q9HBT6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH20Q9HBT6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH20Q9HBT6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH20Q9HBT6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH20Q9HBT6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH20Q9HBT6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH20Q9HBT6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH20Q9HBT6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH20Q9HBT6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH20Q9HBT6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH20Q9HBT6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH20Q9HBT6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH20Q9HBT6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH20Q9HBT6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH20Q9HBT6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH20Q9HBT6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH20Q9HBT6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH20Q9HBT6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH20Q9HBT6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH20Q9HBT6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH20Q9HBT6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH20Q9HBT6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH20Q9HBT6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH20Q9HBT6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH20Q9HBT6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH20Q9HBT6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH20Q9HBT6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH20Q9HBT6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH20Q9HBT6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH20Q9HBT6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH20Q9HBT6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH20Q9HBT6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms