Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB96

FANCE, Fanconi anemia group E protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCEQ9HB96 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCEQ9HB96 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCEQ9HB96 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCEQ9HB96 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCEQ9HB96 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCEQ9HB96 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCEQ9HB96 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCEQ9HB96 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCEQ9HB96 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCEQ9HB96 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCEQ9HB96 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCEQ9HB96 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCEQ9HB96 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCEQ9HB96 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCEQ9HB96 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCEQ9HB96 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCEQ9HB96 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCEQ9HB96 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCEQ9HB96 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCEQ9HB96 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCEQ9HB96 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCEQ9HB96 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCEQ9HB96 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCEQ9HB96 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCEQ9HB96 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCEQ9HB96 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCEQ9HB96 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FANCEQ9HB96 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCEQ9HB96 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCEQ9HB96 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCEQ9HB96 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCEQ9HB96 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCEQ9HB96 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCEQ9HB96 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCEQ9HB96 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCEQ9HB96 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCEQ9HB96 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCEQ9HB96 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCEQ9HB96 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCEQ9HB96 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCEQ9HB96 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCEQ9HB96 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCEQ9HB96 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCEQ9HB96 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCEQ9HB96 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCEQ9HB96 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCEQ9HB96 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCEQ9HB96 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCEQ9HB96 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCEQ9HB96 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCEQ9HB96 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCEQ9HB96 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCEQ9HB96 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCEQ9HB96 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCEQ9HB96 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCEQ9HB96 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCEQ9HB96 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCEQ9HB96 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCEQ9HB96 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCEQ9HB96 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCEQ9HB96 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FANCEQ9HB96 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCEQ9HB96 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCEQ9HB96 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCEQ9HB96 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCEQ9HB96 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCEQ9HB96 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCEQ9HB96 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCEQ9HB96 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCEQ9HB96 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCEQ9HB96 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCEQ9HB96 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCEQ9HB96 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCEQ9HB96 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCEQ9HB96 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCEQ9HB96 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCEQ9HB96 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCEQ9HB96 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCEQ9HB96 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCEQ9HB96 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCEQ9HB96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FANCEQ9HB96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCEQ9HB96 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCEQ9HB96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCEQ9HB96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCEQ9HB96 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCEQ9HB96 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCEQ9HB96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCEQ9HB96 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCEQ9HB96 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms